Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Yipf3Q3UDR8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Yipf3Q3UDR8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Yipf3Q3UDR8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Yipf3Q3UDR8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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