Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trip13Q3UA06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trip13Q3UA06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trip13Q3UA06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip13Q3UA06 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms