Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U6N9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U6N9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3U6N9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U6N9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3U6N9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3U6N9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3U6N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms