Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf1Q3U3R4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf1Q3U3R4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf1Q3U3R4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmf1Q3U3R4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms