Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a5Q3TYU2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a5Q3TYU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a5Q3TYU2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms