Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
InipQ3TXT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
InipQ3TXT3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
InipQ3TXT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms