Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt2Q3TTY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt2Q3TTY5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt2Q3TTY5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt2Q3TTY5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms