Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21440Q3TTD8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21440Q3TTD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21440Q3TTD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21440Q3TTD8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms