Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9130409I23RikQ3TS87 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9130409I23RikQ3TS87 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9130409I23RikQ3TS87 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
9130409I23RikQ3TS87 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9130409I23RikQ3TS87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9130409I23RikQ3TS87 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms