Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp4cQ3TKR3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrp4cQ3TKR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4cQ3TKR3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4cQ3TKR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms