Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms