Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Jmjd8Q3TA59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Jmjd8Q3TA59 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms