Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KncnQ307W7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KncnQ307W7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KncnQ307W7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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KncnQ307W7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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KncnQ307W7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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KncnQ307W7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KncnQ307W7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KncnQ307W7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KncnQ307W7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms