Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf3ip1Q149C2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf3ip1Q149C2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf3ip1Q149C2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf3ip1Q149C2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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