Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gcnt1Q09324 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gcnt1Q09324 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gcnt1Q09324 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcnt1Q09324 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcnt1Q09324 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms