Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad51Q08297 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51Q08297 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rad51Q08297 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad51Q08297 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms