Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pou6f1Q07916 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou6f1Q07916 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou6f1Q07916 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms