Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Col17a1Q07563 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Col17a1Q07563 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Col17a1Q07563 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Col17a1Q07563 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Col17a1Q07563 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Col17a1Q07563 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Col17a1Q07563 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Col17a1Q07563 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Col17a1Q07563 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Col17a1Q07563 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Col17a1Q07563 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms