Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrepQ07475 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NrepQ07475 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms