Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox13Q04891 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox13Q04891 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox13Q04891 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox13Q04891 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms