Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox9Q04887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox9Q04887 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox9Q04887 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms