Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelaQ04207 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RelaQ04207 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RelaQ04207 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RelaQ04207 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RelaQ04207 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RelaQ04207 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RelaQ04207 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelaQ04207 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelaQ04207 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelaQ04207 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RelaQ04207 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelaQ04207 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RelaQ04207 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelaQ04207 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RelaQ04207 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms