Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crisp3Q03402 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Crisp3Q03402 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Crisp3Q03402 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms