Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfiaQ02780 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NfiaQ02780 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfiaQ02780 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NfiaQ02780 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfiaQ02780 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms