Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb4Q02738 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb4Q02738 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gjb4Q02738 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb4Q02738 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms