Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RykQ01887 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RykQ01887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RykQ01887 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RykQ01887 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RykQ01887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RykQ01887 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RykQ01887 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RykQ01887 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RykQ01887 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RykQ01887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RykQ01887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RykQ01887 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RykQ01887 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RykQ01887 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RykQ01887 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RykQ01887 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RykQ01887 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RykQ01887 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RykQ01887 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RykQ01887 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RykQ01887 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RykQ01887 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RykQ01887 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RykQ01887 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RykQ01887 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RykQ01887 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RykQ01887 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RykQ01887 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RykQ01887 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RykQ01887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RykQ01887 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RykQ01887 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RykQ01887 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RykQ01887 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RykQ01887 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RykQ01887 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RykQ01887 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RykQ01887 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RykQ01887 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms