Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col1a2Q01149 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col1a2Q01149 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col1a2Q01149 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Col1a2Q01149 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms