Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrcdQ00LT2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrcdQ00LT2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms