Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Serpina1cQ00896 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Serpina1cQ00896 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpina1cQ00896 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpina1cQ00896 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms