Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou1f1Q00286 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou1f1Q00286 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pou1f1Q00286 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms