Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pitx2P97474 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms