Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp2P97299 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfrp2P97299 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp2P97299 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfrp2P97299 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sfrp2P97299 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms