Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UrodP70697 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UrodP70697 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UrodP70697 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UrodP70697 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UrodP70697 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UrodP70697 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UrodP70697 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UrodP70697 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UrodP70697 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UrodP70697 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UrodP70697 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UrodP70697 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UrodP70697 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UrodP70697 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UrodP70697 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UrodP70697 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UrodP70697 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UrodP70697 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UrodP70697 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UrodP70697 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UrodP70697 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UrodP70697 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UrodP70697 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UrodP70697 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UrodP70697 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UrodP70697 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UrodP70697 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UrodP70697 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UrodP70697 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UrodP70697 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UrodP70697 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UrodP70697 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UrodP70697 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UrodP70697 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UrodP70697 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UrodP70697 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UrodP70697 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UrodP70697 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UrodP70697 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UrodP70697 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UrodP70697 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UrodP70697 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UrodP70697 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UrodP70697 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UrodP70697 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UrodP70697 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UrodP70697 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UrodP70697 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms