Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sparcl1P70663 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sparcl1P70663 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sparcl1P70663 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms