Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rad50P70388 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rad50P70388 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rad50P70388 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad50P70388 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad50P70388 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rad50P70388 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rad50P70388 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad50P70388 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad50P70388 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rad50P70388 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad50P70388 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rad50P70388 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms