Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad1P70340 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad1P70340 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad1P70340 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad1P70340 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad1P70340 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad1P70340 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smad1P70340 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms