Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sycp3P70281 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sycp3P70281 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sycp3P70281 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sycp3P70281 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms