Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrig1P70193 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrig1P70193 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms