Protein–RNA interactions for Protein: P63318

Prkcg, Protein kinase C gamma type, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcgP63318 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcgP63318 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcgP63318 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcgP63318 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcgP63318 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms