Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4P63054 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4P63054 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4P63054 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4P63054 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4P63054 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4P63054 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4P63054 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4P63054 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms