Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,35□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,34□□□□□ -0,27
Rps28P62858 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,33□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,33□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13,33□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,33□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13,33□□□□□ -0,28
Rps28P62858 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13,32□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,31□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,31□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,31□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13,31□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,31□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,3□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13,29□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,28□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,28□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13,28□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,28□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,28□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,28
Rps28P62858 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,27□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,26□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,25□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,24□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Rps28P62858 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,23□□□□□ -0,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms