Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23P62830 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl23P62830 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms