Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou3f4P62515 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f4P62515 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f4P62515 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms