Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmc1P62192 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmc1P62192 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms