Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx1bP61264 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx1bP61264 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 560.3 ms