Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Siah1aP61092 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Siah1aP61092 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Siah1aP61092 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Siah1aP61092 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Siah1aP61092 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms