Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ActbP60710 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ActbP60710 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ActbP60710 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ActbP60710 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ActbP60710 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ActbP60710 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ActbP60710 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ActbP60710 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ActbP60710 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ActbP60710 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ActbP60710 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ActbP60710 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ActbP60710 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ActbP60710 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ActbP60710 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ActbP60710 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ActbP60710 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ActbP60710 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ActbP60710 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ActbP60710 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ActbP60710 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ActbP60710 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ActbP60710 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ActbP60710 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ActbP60710 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ActbP60710 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ActbP60710 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ActbP60710 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ActbP60710 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ActbP60710 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ActbP60710 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ActbP60710 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ActbP60710 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ActbP60710 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ActbP60710 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ActbP60710 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ActbP60710 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ActbP60710 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ActbP60710 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ActbP60710 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ActbP60710 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ActbP60710 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ActbP60710 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ActbP60710 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ActbP60710 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ActbP60710 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ActbP60710 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms