Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdo1P60334 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdo1P60334 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdo1P60334 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms