Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Pcmtd1P59913 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcmtd1P59913 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcmtd1P59913 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd1P59913 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms