Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sash1P59808 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sash1P59808 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sash1P59808 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash1P59808 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash1P59808 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash1P59808 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sash1P59808 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sash1P59808 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sash1P59808 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sash1P59808 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sash1P59808 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms